Win NT ではどうか分かりませんが、OS入れた後でもパーティションが作れればフォーマット出来ると思います。新しいパーティション作るのなら、既存のパーティションを壊さずに出来るのはずなので、まずは、新しいパーティションが作れるか試してみてはどうでしょう?